宗教法人名義の土地を、個人名義に変更する方法

買って代金を支払ったら法務局で不動産登記する。
これ以外の取引のご質問でしたら、もう一度、どのような条件でどの部分に疑問があるのかを「新しく」質問を立ててください。

宗教法人名義の土地を個人名義へ変更するには、「宗教法人から個人への譲渡」という扱いとなり、売買・贈与いずれの形式でも登記原因を明確にしたうえで、法務局で名義変更登記を行う必要があります。
ただし、宗教法人の財産処分には宗教法人法第19条に基づく規定があり、所轄庁（都道府県知事または文科大臣）の許可または届出が必要なケースもあります。
また、贈与であれば受贈者に贈与税の課税がなされる可能性も否定できません。
実務的には、事前に宗教法人の規則・所轄庁・税理士・司法書士との協議が不可欠です。