総所得金額の分離長期所得について

分離以外の長期譲渡所得収入があるのだが、所得金額の合計金額がゼロになるということでしょうか？それであれば、事業所得や不動産所得がマイナスになっていると考えますが如何でしょうか？その場合には所得間の損益通算が行われたということで、結果的にゼロであっても長期譲渡収入は含まれております。

回答ありがとうございます。
簡単に言いますと、居住マンションを売却し、購入金額が2300万で売却が1500万で確定申告時にそれを記入しましたところ、市役所でもらってきた総所得額が長期所得で1400万で事業所得は0円だったのです。

長期譲渡所得というのは、売却額から購入額と仲介料などの経費を差し引いた額と聞いたのですが間違えないでしょうか？
また、この額がマイナスなのに総所得金額が反映されるのはなぜでしょうか？