請求書が焼けてしまった場合

火災にあった旨を言ってください。
大変な目に合われましたね。
必要なものは、反面調査或いは相談者様が、取引先からいただけると思います。

火災等により帳簿書類を焼失した場合は、可能な範囲で合理的な方法（取引の相手先や金融機関へ取引内容を照会するなどして帳簿書類を復元する等）により申告書等を作成するとされていますが、申告が終了した年度の書類であれば、同様に税務調査の時は可能な限り合理的な方法で対応することになると思います。

先生回答ありがとうございます。
説明すれば良いということがわかって安心いたしました。