税金の課税タイミング

TikTokライトポイントをPayPayポイントに交換し投資信託を購入・売却した場合、課税タイミングは投資信託売却時（譲渡益）とポイントの経済的利益実現時（交換or使用時）です。 ポイント使用相当額は投資信託の取得費に加算されず、売却益のみ課税対象で、保有中は課税されません。
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各ステップの課税
TikTokライト→PayPayポイント交換: 交換時点で一時所得or雑所得（年間50万円控除後1/2課税）。
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PayPayポイントで投資信託購入: 交換時点課税、購入時は課税なし（ポイント価値は取得費0扱い）。
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投資信託売却: 譲渡所得（売却額－取得費0＝全額課税、申告分離課税20.315%）。

売却益のみ課税対象と全額課税は矛盾してる気がするのですが？

説明不足で大変恐縮です。

売却益のみ課税という説明と、「取得費0なので売却額全額課税」という書きぶりが混ざっていて、そこが違和感の原因かと思います。
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「売却益のみ課税」
→「投資信託の売却による利益部分だけが課税対象」という趣旨です。

「取得費0なので売却額全額課税」
→「TikTokライト由来ポイント分については取得費を計上しないので、『売却額－取得費0』の計算上は売却額＝譲渡益になる」という意味です。
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「利益だけ課税」と「全額課税」が相反して見えますが、前者は「性質・範囲」の話、後者は「計算結果として利益＝売却額になるケース」の話という違いとなります。

TikTokライト→PayPayポイント
交換時点で一時所得または雑所得の収入金額に計上（ポイント取得時点で経済的利益が確定）。
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PayPayポイントで投資信託購入
この時点では譲渡所得は発生せず、ポイント部分については税務上の取得費は0円扱い（ポイント取得時にすでに課税関係を済ませている前提）。
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投資信託売却
課税されるのは譲渡益のみ（譲渡所得）。
ただしポイントで取得した部分の取得費が0円と扱われるため、「売却額－取得費0」という計算結果として、その部分については売却額全額が譲渡益になる、という意味で「全額課税」と表現しておりました。