不動産売却の税金について知りたいです。

税金としては、①一括入金後3分割②初めから3分割で違いは生じますか？

⇒　違いは生じません。所有権の割合で決まりです。

分割後の金額が3000万以下なら特別控除に該当するでしょうか？

⇒　妹さんがご自身に居住用として使用していたのであれば3000万円控除を適用できる可能性がありますが、他の共有者については控除の特例は適用できないと考えられます。この点は依頼する税理士によく検討してもらってください。

石川の税理士さんと大阪の税理士さんとどちらが良いか

⇒　相談が前提であれば、面談しやすい石川の税理士がよいと思います。

返答ありがとうございます。
再度吟味して検討させて頂きます。

お役に立てたとすれば幸いです。