修正申告で還付された消費税の仕訳

税抜経理方式なら、還付された消費税の仕訳は、未収還付消費税の取崩となり、別表4では調整しません。
税込経理方式なら、還付された消費税は益金計上しますので、別表4では調整しません。

ご回答頂きありがとうございます。税抜経理方式を採用しております。

前期において、誤って　借方：荷造運賃　貸方：現預金と仕訳しておりましが、修正申告に関する以下の仕訳も当期ではなく、前期に計上すればよろしいでしょうか。
借方：仮払消費税　貸方：荷造運賃
借方：未収還付消費税　貸方：仮払消費税

はい、修正申告をする際の前期に上記の仕訳を計上していただく形になります。