副業 所得税還付で会社にバレますか？

回答します。
年末調整済みの給与について住民税は特別徴収です。
なお、副業分については、自ら納付する普通徴収が選択できます。
そして、住民税通知書は勤務先に送られ、勤務先経由であなた様の手元に届きます。
その通知書には、あなた様の申告内容として、所得の種類、金額等が記載されているほか、毎月天引きされる住民税の金額が表示されていますので、その情報は給与事務担当のところへ送られます。
バレるとしたら、その時が可能性としてあり得ると考えます。
但し、所得の種類と金額だけの表示なので、聴取された際、回答するのはあなた様です。最後はあなた様次第だと思います。

確定申告をしたら還付金がある計算になりました。
それのことを聞いております！

確定申告の還付金までは通知書に掲載されません。
掲載されるのは、住民税を算定した内容です。

サラリーマンの時の所得税の還付金って給料明細に載りませんか？
それでバレませんか？

本業の所得税の返りと副業の所得税の返りの合算のものが、還付金として
返ってくるんですよね？

それは年末調整の話ですね。
本業の税金は年末調整で還付します。それは給与明細に記載されます。
しかしながら、確定申告は税務署に提出します。副業と合算した上で再計算し還付があるのですが、それは個人情報です。税務署から勤務先にいくら還付したかの情報は出ません。