決算期と異なる書類が届いた

税務署に確認されたら良いと考えます。
何かの手違いと考えます。

手違い以外は考えられますでしょうか？

稼働してない法人は、最近、何かの手続きはされましたか？

何もしておりません。
よろしくお願い致します。

決算期が変わる場合として、解散登記をすると法人の事業年度が変わります。
法人関係者が、解散登記(商業登記)をされたか確認したら良いと考えます。
法務局で、登記事項証明書を取ればわかります。

一昨年、法務局から、みなし解散の通知が来たからでしょうか？

そうですね。その様に判断します。
しかし、法人に実態がなければ、何も手続きはしなくても、特に問題ないと考えます。