株の譲渡損の通算について

特定口座（源泉徴収あり）内の利益を確定申告する場合、口座ごと、かつ、売却益・償還差益、配当等・利子等ごとに確定申告するかどうかを選択することができます。
よって、できるということになります。

ご回答ありがとうございます。
譲渡損の通算をする場合、全部の特定口座の配当とかを申告しなきゃいけないのかと思ったんですが、口座ごとでよいのですね！
大変助かりました！

　B特定口座（源泉徴収あり）内で生じた売却益・償還差益について、A口座で生じた売却損と通算するために確定申告する場合、そのB特定口座（源泉徴収あり）で支払いを受けた配当等・利子等については、申告不要を選択することができます。
　なお、売却損が生じているA口座が特定口座（源泉徴収あり）であり、かつ、この口座に受入れた配当等・利子等がある場合、その配当等・利子等については、申告不要を選択できず、すべて確定申告する必要があります。