マイクロ法人における株式投資の仕訳について

株式投資は金融商品ごとに、もっというと銘柄ごとに処理をしないと整理できません。内側で処理できていて、帳簿に総額ではいっているのは問題ないです。ネット証券側で保存されているという記載からみると、きちんと内側で処理できていないようにもおもいます。

一つで総額の記載をする等、簡略化することは可能でしょうか？

簡略化しないほうがよい。
非課税売上割合も重要です。
ここに分けて仕訳お願いします。

1取引ごとに必ず仕訳を入力しなければならないわけではないと考えます。

証券会社の取引明細等によって銘柄、数量、売買日、売買金額等の個々の取引内容を確認できる状態にしておけば、会計帳簿への入力を日ごとの合計額などでまとめる方法は可能と考えられます。法人税でも、帳簿と取引関係書類を保存することが求められています。

ただし、

「その日の購入総額○円」「売却総額○円」だけを記録して終わり

という方法はお勧めできません。翌日以降も保有する株式があるため、**銘柄ごとの取得価額、保有数量、売却原価、売却損益を追跡できる補助簿（証券会社のデータやExcel等）**は必要です。有価証券については、法人税上も一単位当たりの帳簿価額の算出方法が定められています。

したがって実務的には、

証券会社の取引データで銘柄別の明細を保存 → 会計ソフトには日次等で合計仕訳

という処理が現実的でしょう。

なお、証券会社のサイトで閲覧できるだけでなく、年間取引報告書・取引履歴等を法人側でもダウンロードして保存しておくことをお勧めします。税務調査時にいつでも証券会社から取得できるとは限らないためです。

1日20回程度の売買であれば、40本近い仕訳を毎日手入力する必要まではないと考えます。