副業で自分が勤めている会社商品の販売

この場合，確定申告をする上で，注意するべき点はございますでしょうか？

相談者様と会社の関係ですね。
記載ではわかりません。

関係としては，問題ないです。
会社はネットショップを運営する予定がなく，問合せや営業した顧客に対しての販売をしています。

自分の社員に卸売をして，その社員がネット販売をして，副業として収益を得る感じです。

回答内容を少し間違えました。
相談者は商品を取り扱っている会社の社員になります。
自分が勤めている会社の商品を卸し買いをし，自身の副業として，通信販売をします

税務調査では、個人の利益などを給与や賞与と認定されることもあります。
一度会社の代表と、税務署に相談してからおこなってください。
ただ単に相談だけではなく、相談内容の回答をいただいてください。