青色申告承認申請書

青色申告は帳簿作成が前提ですので、何の記入もないのはまずいです。
作成予定の記帳方法と書類を記入するようにしてください。
宜しくお願いします。

実際に提出するときに申請書の記入と違うもので提出しても大丈夫でしょうか？

申請書に記載する帳簿類は申告時に税務署に提出することはありません。納税者が作成し保存しておくものです。
申請するときに記入するものは作成「予定」の書類になりますので、その後に作成する書類が変わることはあり得る話です。
従って、申請書に記載した書類がその後に異なったとしても問題になることはありません。
宜しくお願いします。