確定申告

副業が給与所得の場合、市区町村の課税処理が間に合えば納税通知書は本業のほうに5月中に送付されると思います。副業が給与所得の場合、遅れても遅れなくても確定申告したことで本業の方に副業がバレる可能性はあります。

副業は報酬(雑所得)となっています。
この場合は通知書が2度送られてしまうようなことは有り得るでしょうか？

副業が雑所得であれば、確定申告の時に副業の所得の住民税の納付を自分で納付(普通徴収)を選択できます。そのため副業の所得の情報が会社に漏れません。給与所得については特別徴収、雑所得については普通徴収で納税通知書が送付されます。