年末調整について

確定申告は、本業と副業を合わせて所轄の税務署にて確定申告をします。

・本業と副業両方とも年末調整してしまったことに関しては気にしなく良いと言うことになりますでしょうか？
・後副業でバイトをしてるので確定申告した際は給与所得扱いになるので確実に本業に副業をしてることはバレるのでしょうか？

すでに年末調整が終了していれば、そのまま確定申告hしてよいと思います。なお、副業の収入金額、住民税額により本業にバレる可能性はあると思います。