副業の確定申告

　　給与と年金の所得以外は、確定申告の際に、住民税の納付方法について「自分で納付」を選択できます。給与所得の場合は、特別徴収になります。

会社員の追徴徴収は特別徴収の選択肢しかないということでしょうか？

給与と年金の所得以外は自分で納付を選択することによって、普通徴収によることができます。
したがいまして副業分の所得は会社に発覚することはありません。

　　副業が給与所得の場合、原則としてすべて特別徴収になります。天引額や所得の合計額で副業がわかる可能性があります。副業の所得が給与の場合、ご自分で納付が出来るかどうか念のためお住いの自治体に問い合わせてみてはいかがでしょうか。