所得税が高過ぎる

事実関係が良くわかりません。以下の2点を教えてください。

・所得の種類を教えてください（給与・雑・譲渡など）。
・41,000円の所得税とは確定申告に伴う納税分でしょうか。

夜分にすみません。給料何ですけど所得控除の書類を提出したのですけど会社に届いてないとの理由で高い方の所得税を徴収すると言われました。説明が上手く伝わらなくてすみませんでした。

「給与所得者の扶養控除等申告書」を会社に提出していない（届いていない）ので、給与計算を「乙欄」にて計算されたためだと思います。
改めて会社に「給与所得者の扶養控除等申告書」を提出すれば、通常の税率（「甲欄」といいます）で給与計算をするので、源泉所得税の額は下がると思います。

回答ありがとうございました。色々なアドバイスのお陰で解決出来ました。