トレカをまとめ買いし、一部売却した場合の確定申告について。

【結論】
結論から申し上げますと、年間の利益額によっては確定申告が必要になる可能性が高いです。また、まとめ買いしたカードの1枚あたりの取得金額の計算は、ご質問に記載していただいた「店舗での買取見込み金額に応じて割り振る方法（3枚が各500円など）」が正解となります。

【理由】
理由は以下の通りです。

確定申告の必要性について
本来、ご自宅にある生活用品や趣味の品（生活用動産といいます）を売却した利益は非課税となります（所得税法9条）。しかし、週3件の継続的な購入と月10万円規模の売却があり、買った値段より高く売れることが多々あるという実態を踏まえると、客観的に見て「営利目的で反復継続して行っている」と税務署に判断され、「雑所得」あるいは「事業所得」として課税対象となる可能性が非常に高いためです。
専業主婦の方で他に収入がない場合、1年間の利益（売上から経費を引いた金額）が基礎控除額の48万円を超えると、確定申告が必要になります。

取得金額の計算方法について
複数の異なる価値のものを一括で購入し、それを個別に売却する場合、購入代金（2000円）をそれぞれの時価（販売見込み額）の割合に応じて割り振るのが、税務上最も合理的で正しい計算方法とされています。
単純に枚数で割って「すべて1枚50円」としてしまうと、価値のないノーマルカードも、価値の高いレアカードも同じ原価となってしまい、正しい利益が計算できなくなってしまうためです。ご自身で考えられた計算式は、理にかなった方法です。

大変丁寧なご返信をいただき、ありがとうございます。
追加で2点質問があるのですが、お教えいただけますでしょうか？

まとめ買いしたカードについて、店舗での買取見込み金額を記録する際、金額がつくすべてのカードについて、店舗の買取表のスクリーンショット等が必要になりますでしょうか？

また、記録する買取金額は、まとめ買い商品を購入した当日のものである必要がありますでしょうか？それとも数日以内、1ヵ月以内、または1年以内の買取表など、購入日から、どれだけの期間のものが認められますでしょうか。
（購入時に記録し忘れた際、後からどう記録すれば良いか気になりました）

難しいかもしれませんが、お手隙の際にご回答頂けましたら幸いです。
よろしくお願いいたします。

【結論】
結論から申し上げますと、すべてのカードのスクリーンショットが必須というわけではありません。また、買取見込み金額の記録は、原則として「購入日当日（またはその直前直後）」のものである必要があります。

【理由】
理由は以下の通りです。
・税務上、一括購入した資産の取得原価を分ける際は、「取得した時点での時価（客観的な価値）」の割合で計算するのが原則とされているためです（所得税基本通達の時価按分の考え方に基づきます）。特にトレカは価格変動が激しいため、数ヶ月前や1年前の価格を用いてしまうと、購入時の正しい価値割合を示しているとは認められにくくなります。
・確定申告の際には帳簿や証拠書類の保存が求められますが、税務署に対して「計算の根拠が合理的であること」を説明できればよいためです。高額なカードの根拠がしっかりしていれば、少額のカードまですべて画像が揃っていなくても、全体としての信用性は確保されやすくなります。

休日にもかかわらず、迅速にご返信頂きましてありがとうございます。
とてもよく分かりました。

カードをまとめ買い購入した際は、当日または数日以内に、各カードの買取価格を記録しようと思います。

また、単価が1000円以上のカードについては買取価格表のスクリーンショットも残しておこうと思います。

この度は、終始ご丁寧にご対応いただきましてありがとうございました。
とても信頼できる税理士様だと思いました。

どうもありがとうございました。