確定申告　したほうが良いのか

年間の払戻金から「的中した車券の購入代金」を引いた利益が、50万円を超える場合に申告義務が発生する可能性があります。
〈一時所得の計算式〉
年間の払戻金合計 - 的中した車券の購入代金 - 特別控除50万円 = 一時所得の金額

この計算結果が 0円より大きく、かつ他の所得と合わせて一定の基準（会社員なら給与以外の所得が20万円超など）に達する場合に申告が必要です。

◎注意ポイント
1. 「外れ車券」は経費にならない
最も重要な点ですが、外れた車券の購入代金は原則として経費にできません。
例：100万円投資して110万円払い戻された場合、利益は10万円ではなく「110万円 − 的中した車券代」で計算されるため、税務上の利益は非常に大きくなる可能性があります。

2. 特別控除（50万円）の枠
一時所得には最大50万円の特別控除があるため、年間のプラス（的中時のみの利益）が50万円以下であれば、申告は不要です。

また、税務調査が来るかどうかではなく、所得を適切に計算し、申告されるべきかと存じます。

計算したら差し引いて48万円だったのですが
去年のやつ会社で年末調整したのですが
この場合は契約社員でも会社とべつで確定申告したほうがいいんですか？

48万円というのは下記の計算式にある通り、特別控除額50万円を差し引いた後の金額でしょうか？

年間の払戻金合計 - 的中した車券の購入代金 - 特別控除50万円 = 一時所得の金額

特別控除差し引く前が48万円です。
この場合はどうすればよろしいのでしょうか？

その場合は特別控除額50万円を差し引くと、一時所得は0円なので、申告の必要はないかと存じます。