還付金額について

所得税還付金の上限額は、年末調整後に交付を受ける給与所得の源泉徴収票の源泉徴収税額です。

個人事業主なので支払調書しかもらえないのですがそれに書いてありますか？

支払調書には支払金額と源泉徴収税額が記載されています。還付金はその源泉徴収税額（複数枚ある場合は合計額)が上限です。

報酬を会社から頂くときに所得税がひかれていますが、この引かれた所得税の合計額が還付金の上限ということでしょうか？

そうです。
例えば、住宅借入金等特別控除が計算上は30万円となっても、源泉徴収税額が20万円しかなかったら、20万円しか還付されないことになります。