確定申告について

回答します。
両方を合わせ申告してください。
理由は、あなた様自身の控除である基礎控除48万円が、二重に控除さらているからです。納付になる可能性が高いので、3月15日までに済ませください。

ご回答ありがとうございます。
両方合わせると言うのは
二か所の所得の合計金額を計算して
提出すると言う事でしょうか？
e-tax？というものでやってみたのですが
年末調整済の物が一つしか入力できないのですが
それぞれの確定申告書を作成し一緒に提出という事ですか？

年末調整は1箇所の給与しかできないことから、年末調整済みの源泉徴収票は1枚しか受け付けないと考えます。
このため、あなた様の場合は、2枚とも年末調整未済の源泉徴収票として入力すれば可能だと思います。
そして、申告書は一人一枚しか提出できないことから、別々に計算することはできません。