確定申告の科目について

その場合、会社から振り込まれる金額はすでにその仕入れ材料費を引かれた金額になっているのですが、これはそのまま振り込まれた金額を収入として申告すればいいのでしょうか？

→それで問題ありません。

またそれとは別に別途必要になった細々した材料を大手ホームセンターなどで購入することがあるのですが、そちらの科目は「消耗品費」なのか「仕入」になるのかどちらでしょうか？

→仕入のほうが適切かと思います。

ご教示ありがとうございます。
材料費は「仕入高」という考え方になるのですね。
では材料以外の事業に使うコピー代や備品代などは「消耗品費」での計上で間違いないでしょうか？
今年から事業を始め、初めての確定申告のため初歩的な質問で申し訳ございません。
よろしくお願いいたします。

材料以外の事業に使うコピー代や備品代などは「消耗品費」での計上で間違いありません。

ご教示ありがとうございました。
大変助かりました。