住宅ローン控除と単身赴任

①単身赴任の場合は、家族が新居に居住しているのであれば住宅ローン控除は受けられます。
②家族と共に新居を離れて転居した場合にはその期間のみ受けられませんが、12月31日現在で新居に居住している場合にはその年分は適用されますので、１年未満の期間であれば問題ありません。

上記②の家族と共に転居する場合には税務署への手続は必要ですが、①の場合は不要です。ただし、住民票と事実関係が一致しないことになると思われますので、税務署からの問い合わせに備えて、単身赴任がわかる書類などを用意しておいた方がいいと思います。
国税庁ホームページのタックスアンサー№1234にその説明があります。

回答ありがとうございます。
追加で質問してもよろしいでしょうか。
すまい給付金の申請しても大丈夫でしょうか。
収入や他条件は該当するのですが、①の場合適用されるのか教えてください。

単身赴任者についても「すまい給付金」は認められています。

住民票で居住を確認するので、国土交通省の定める手続きに従えば原則として認められないことになります。
しかし、平成29年に総務省が国土交通省に申請要件の緩和をあっせんした結果、以下のような取り扱いとなりました。つまり、個別対応とするということですので、事務局にどのような書類が必要か問い合わせることになります（公表はされていません）。
「住宅取得者が取得住宅に入居していることを確認できない場合は、原則申請できません。ただし、転勤等やむを得ない事情により取得住宅への入居が確認できない場合は、給付を受けられる場合があります。事務局に個別にお問い合わせください。」

総務省の斡旋（抜粋）
「国土交通省は、住宅ローン減税の運用と同様に、単身赴任者に対して、配偶者の住民票の写しの提出等により、すまい給付金の申請を認める必要がある」

なお、「住まい給付金」を受領すると、その分住宅取得価額は減少しますので、住宅ローン控除額が減少する可能性があります。

ありがとうございます。
大変助かりました。