確定申告　会社を有限会社から株式会社へ？

法人形態は関係ありません。
休眠していた間、申告していないのであれば、青色申告が取消されているはずなので、事業再開に伴い、再度青色申告の承認申請を行う必要があります。

藤本先生、ありがとうございます。

管轄税務署に青色申告が取り消されていないか確認するのが第一ですね。
取り消しされているとその年月日を教えてくれます。
その上で、取り消しから一年以上経過していれば、青色申告の届け出を出せば、次期より青色申告を受けることができます。

休眠していた期間については、県税、市区町村等に相談されると均等割について納税不要となる余地がありますので、申告前に、要相談でしょうか。その上で、申告書を提出することになりますが、会計法上、均等割りの受領も5年しかありません。それ以前は時効で、税金を受領することも出来ません。ですので、何時の分から申告書を提出できるのか、提出先毎に事前にご相談されるのが先決です。

相田先生、早速ありがとうございます。