外国籍の永住者です。母国の口座は確定申告で申告すべきか

こんにちは。なおみ税理士事務所です。

「外国籍の永住者である」というタイトルと、

　「ベルギー国籍で日本に永住しています」という文脈から、所得税法上、日本に住所を有する「居住者（永住者）」であると推測されるので、それをを前提として回答します（所得税法２条）。

　居住者の場合、全ての所得に対して課税されます（全世界所得課税）（所得税法５条、７条）。
　そのため、ベルギーで得た所得についても課税されるため、確定申告をしなければなりません。
　
　質問には、「　AEoI/CRS通知　」　とあるので、おそらくは利息収入や配当金収入があると思いますので、それを含めて修正申告をすることとなります。
　修正申告をしないと、追徴税額が決まらず、追徴税額が決まらないと加算税などの金額も決まらないため、まずは修正申告をすることをお勧めします。
　加算税については、追徴税額が一定以上の場合には、税務署から通知が送られてきますので、質問者さまが何かをするということはありません。

　質問者さまの手続きとしては、修正申告をして、追徴税額が発生すればその追徴税額を納めることです。