住宅購入のため、妻の預金を夫名義の口座へ移した場合の贈与税について

夫婦間のことですので、とてもグレーゾーンですので答えにくいところもありますが、公の場で答えられる範囲で答えさせていただければと思います。

贈与税については、現段階で2つ生じていますので、一つ一つ順を追ってご説明したいと思います。

一つ目：
奥様のの預金1,100万円をを夫名義の口座へ移した場合は、単にあげたのであればご理解の通り贈与税がかかってきます。
しかし貸したんだよ、ということで借用書などを作成され返済してもらうのであれば贈与とはなりません。

二つ目：
一つ目の口座間の資金の移動を貸付金とするなら、本来奥様の持ち分は　
頭金200万円　/　物件価格　3,300万円　≒　6％　となっているはずです。
しかしご主人名義で全部登記しているので、この6％部分が、奥様からご主人への贈与となってきます。
・贈与税の課税価格
物件価格　3,300万円　×　6％　＝　198万円
・贈与税額
198万円　－　110万円　×　10％　＝　88,000円

また今からでも共有名義に変更する方法もあります。
その際には、不動産の持分を訂正する登記（所有権更正登記）となり、登録免許税が不動産一つにつき1,000円かかります。

ご回答ありがとうございます。まだ方法があるとわかり、少し落ち着きました。
所有権更正登記をする場合、私の持ち分は39%(1300万)として不自然にならないでしょうか？

まあ、不自然といえば不自然ですが。
貸した辻褄があわなくなりますが、その辺はうまく説明できれば39％の持ち分で更正登記してもいいとは思います。
最初にも書かせていただいたように、グレーゾーンですので、これなら絶対に大丈夫とは言えないこと、ご了承いただければと思います。

とても参考になりました。
どちらにするかはもう少し考えてみます。
ありがとうございました。