二世帯住宅　義両親援助

ご相談者様が気がかりにされているとおり、ご相談者様がその2,500万円を貰うということになりますと、贈与税の負担が生じてしまいます。
2,500万円の贈与についての税額としては、945万円とかなり高額になりますので、その建物に義理のご両親の名義も入れられてはいかがでしょうか。

早速のご回答ありがとうございます。
住宅取得資金等の贈与を受けた場合の贈与税の非課税の特例を見ているのですが、
省エネ等住宅であれば1500万円の非課税制度を利用できるとのことで、妻が義両親から1500万円の贈与を受け、その分の持ち分を持ち、残りの1000万円を義両親の持ち分にするというのはあまりよろしくないのでしょうか。

しつこくなり申し訳ありませんが、ご教授頂ければ幸いです。

残念ながら、住宅取得等資金贈与の非課税は、直系尊属からの贈与について適用できますので、ご相談者様の場合、直系尊属からの贈与になりませんので、適用ができないのです。

国税庁HP:直系尊属から住宅取得等資金の贈与を受けた場合の非課税
https://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/taxanswer/sozoku/4508.htm

説明不足でした。
直系尊属である妻が両親（私から見ると義両親）から1500万円の贈与を受け、持ち分も持つということです。
土地は私名義、建物を一部私、1500万円の部分を妻の名義ということもできないのでしょうか。

それでしたら、適用可能性があります。
直系尊属からの贈与であること以外にも要件がありますので、上記URLより他の要件も満たしているか、よくご確認ください。