世帯分離した息子への給与

　世帯分離しても、そのまま別生計とみなされるわけではありません。
　それぞれの世帯が別生計で生活しているか（財布が別か）が判断基準になります。例えば家計が別々（水道光熱費や食費を別の財布から出している）のが明らかであれば、別生計と認められると思います。
　もし完全に別生計であれば、息子さんの給与も経費と認められる可能性がありますが、その際は源泉徴収や年末調整の義務が発生し、給与支払報告書も提出することになります。今まで給与を支払う人がいなかった場合は、税務署に届け出も必要です。

回答ありがとうございました。
食費や教育費、その他支払いは完全に別なのですが、同じ家に住んでいるので光熱費などは曖昧なところがあります。
では、世帯分離しても今まで通り白色専従者として控除（50万）してもいいのでしょうか？

　生計を一にしている、という判断であれば、今まで通り事業専従者控除を適用していただくことになります。
　判断が難しいところなので、税務署に問い合わせてみるのもよいかもしれません。