住宅ローン控除について

住宅ローン控除の控除額が、本業の給与にかかる所得税額よりも大きい場合で、会社の給与担当者が税務に詳しい方でしたら、給与以外の収入があるのではと疑われる可能性があります。
よく勉強されている給与担当者でなければ気付く可能性は低いですし、「給与以外の収入がある」くらいしかわからないようになっていますので、副業にあたらないような所得(仮想通貨の利益など)があったことにすればバレにくくなるのではないでしょうか

アフィリエイトなどの副業ではダメだということですか？

アフィリエイトの収入は雑所得といって、仮想通貨の利益などと同じ区分になります。
「他社に雇用される」ことを副業と定義している会社が多いので、アフィリエイトが副業にあたらないようでしたら、心配する必要はないです