個人事業主からの入金の納税について

入金の原因は何でしょうか？
売上代金であれば、その売上が法人であれば法人税、個人であれば所得税です。
保証金や敷金など後で返金するものであれば、預り金なので課税されません。まあ、家賃や地代は受け取り側が個人なら所得税、法人なら法人税です。

簡単に書きましたが、法人税には法人都道府県民税、法人市町村民税、法人事業税などを含み、所得税には個人市県民税、個人事業税を含みます。

個人から個人への贈与なら贈与税、法人から個人への贈与なら所得税です。

入金の原因はちょっとした謝礼（お小遣い）です。これは，屋号＋個人名の個人事業主から個人への入金ですが，個人事業主は法人扱いになるのでしょうか？

個人→個人からの入金で贈与税かと思いましたが
法人→個人からの入金の所得税・住民税になるのでしょうか？

個人事業主はあくまで、個人です。法人にはなりません。
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個人→個人からの入金で贈与税かと思いましたが

贈与は対価性が全くないものです。
何かの謝礼ということは、贈与とは考え難いです。
なお、一般的な儀礼で行う、お中元やお歳暮の類いは所得や贈与として課税は受けません。

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法人→個人からの入金の所得税・住民税になるのでしょうか？
贈与税は相続税の補完（個人間のやり取りが課税の対象）です。
法人は、相続が起きないので贈与税はかかりません。