海外在住で日本向けのサービスを行い収入を得ています。

「日本のサーバーがPE（恒久的施設）にあたり、課税の対象となる、という情報」というのはどこでだれに聞いたのですか。昔はサーバーのあるところとかいう話がよくありましたが、いまはサービス提供事業者がどこにいるかというふうになって、そういう話はあんまり聞きません。ＰＥではないと思います。ほかの税理士さんの意見もでるといいです。

国税局に確認したところ、「サーバーがPEになる」、との見解を示されました。

年収の金額にもよるのかもしれませんが、海外在住者でもブログアフィリエイトで得た収入の確定申告が必要である、ということを言われました。

サーバーがPEの場合、税金を収める場所は「サーバーの所在地でお願いします」、という回答でした。

必要があるなら納税はいたす所存ではありますが、情報に振り回されて困っております。

調べました。たしかにサーバーも恒久的施設の例示にあがってます。ただし、サーバーを事業者が売ったり、やめたり、人に貸したり、他の用途に転用できたり自分でコントロールできる場合だそうです。ブログ業者のサイトを使ってブログを出すときはたぶんＰＥでないと思うのですが、あなたの場合はいかがですか。

日本にあるサーバーがＰＥとして、そこに帰属する所得がどれくらいかといったら限りなくゼロのような気がします。サーバーＰＥで申告している非居住者がどれくらいいるかといったらこれもいないように思います。
ＡＳＰ（アプリケーションサービス提供事業者）からアフリエイト収入をもらっている非居住者が日本で申告する所得はＰＥがないからゼロだそうです。自分のレンタルサーバーが日本にあるだけで、急に申告額が増えるとは思えません。

ご回答ありがとうございます。

そうですねまずは、
サーバーを事業者が売ったり、やめたり、人に貸したり、他の用途に転用できたり自分でコントロールできる場合

この点をサーバー会社に確認してみようと思います。

私が確認した国税局の職員の方は、本来であれば各国税局で認識が異なることはあってはならないことですが・・・とおっしゃっていましたが…

年収の金額も関係しているのでしょうか。
今年はアフィリエイトとコンサル業で年収は１０００万円を超えそうです。