親子間の資金移動について

そこで私の口座で直接管理したいと思い昨年約3000万円資金移動しました。そこからさらに私のNISA口座に資金移動して投資信託等に預け入れしてしまいました。
今年さらに約900万円資金移動し投資信託等に預け入れてしまいました。

すべきことではなかったですね。
自身の名義で投資に充てるのは、悪い言い方をすれば「使い込み」です。
お母様が知らないということであれば、贈与契約は成立していませんのですぐに戻してはいかがですか。
ただし、税務署がこの取引履歴を把握し、贈与を疑う可能性はあります。
税務調査の問題ですのでどうなるかは断言できません。
もしも指摘された場合は、事実を主張してみてください。

中田先生早速の回答ありがとうございました。
全く私の軽率な行為で大変反省しています。

移動した資金は今月~来月には全額戻すつもりです。ただ、これだけの大金を母親⇒私⇒母親と資金の移動があるとやはり税務署からのお尋ねが来る可能性は高いのでしょうか。
税務調査の結果贈与だと言われ、無申告加算税~延滞金という事態になるのが最も不安なところです。
前述の通り、母親はこれだけの大金が入金されたことは把握しておりません。

贈与税の調査は一般的に相続税と一緒に行われます。
したがって、将来のお母様の相続までは税務署はこの取引を把握することはないと思われます。
ただし、先の回答のとおり、税務調査の問題ですのでどうなるかは断言できません。
お母様の口座に戻すかどうかは、ご自身で判断してください。

再びの回答、ありがとうございます。
漠然とした不安を抱えたくないので全額母親の口座に戻す予定です。
今回の一件、ありがとうございました。