土地の共有名義を単独名義にした場合、贈与税などかかりますか？

2人が共有持分を放棄して単独名義になった場合、原則として贈与税の対象になります。

放棄するということは、一人に贈与するということでしょうから、贈与税（相続税）評価額に応じた贈与税がかかります。
また、不動産取得税、登記時の登録免許税、今後の固定資産税などがかかるでしょう。
もしも、どうしても贈与しなければならないわけではなければ、たとえば贈与をせずに、贈与しようとしていた一人の子に遺贈する旨の遺言書を他の二人の兄弟に作成してもらえば相続になり節税になると思われます。