夫単独ローンで購入した住居の手付金を妻の口座から払った場合の贈与税について

ご提示いただいたケースについて、税務上の観点から回答いたします。

① 手付金200万円の精算について
妻名義の「口座B」から同じく妻名義の「口座A」へ200万円を移動するだけでは、外形上「妻個人の口座間の資金移動」と見なされ、夫から妻への返済（手付金立替の精算）として証明することが困難となります。
現在夫自身の口座に200万円がないとのことですので、まずは口座Bにある「夫の拠出分」から200万円を夫名義の口座へ移し、その後、夫の口座から妻の口座Aへ「手付金立替精算」として振り込む手順を踏むことをお勧め致します。
これにより、資金の流れと精算の事実が客観的な記録として残ります。

② 夫婦の共有口座（口座B）の分割について
「おおよその金額」で夫の口座へ戻すことには、実際の拠出額との差額が「妻から夫への贈与」とみなされるリスクが伴います。
結婚当初の記録が曖昧な場合でも、当時の夫婦の収入比率や、明確に判明している期間の拠出割合など、可能な限り客観的かつ合理的な基準を用いて計算してください。
その上で、その計算根拠とともに「夫婦の共有財産をそれぞれの拠出実績に基づいて分割・精算した」という旨の覚書（合意書）を夫婦間で作成し、署名・押印しておくことなどすると、後日税務調査等があった際、単なる資金移動（贈与）ではなく預け金の精算であることを主張するための有力な証拠となります。

回答は以上となります。
ご参考になりましたら幸いです。

夫婦共同のB口座に、これまで、夫の収入から200万円以上の入金をしていたなら、その分を引き出して妻に返済という形をとれば贈与にはならないと思います。
　日本の税法には、夫婦共有口座という概念がありません。
　夫婦共同で使用する生活用口座を設けるなら、必要なだけ入金し、残高が多額にならないように管理することをお勧めします。