死亡前に移動させた財産を相続財産から除くことができるか

こんにちは。
お父様のご逝去にお悔やみを申し上げます。
ご質問の件ですが、特に問題ありません。
お父様がお亡くなりになった日現在の残高証明を請求すると、実際のと言いますか、本来の残高より100万円多くなっているということですよね。
この場合、その口座の残高は、100万円多い残高で認識して下さい。
その代わり、お父様の債務として、お母さまより100万円借入れたものとして債務金額100万円を認識すれば、行ってこいになります。
相続税の申告書を提出する場合は、残高証明の金額により、債務控除として、お母さまからの借入金100万円を記入して下されば問題ありません。
ご検討をお願いいたします。

さっそくのご回答ありがとうございました。母から父への借用書のようなものはなく、母の口座からの出金記録と、同日に父の口座に500万円の入金記録（父の別の口座からうつした400万円と母からの100万円を合わせて500万円）があるだけなのですが、借入の証明になるでしょうか。

こんにちは。
例え、借用書が無いとしても、お母さまに贈与の意思が無いことを主張して下さい。そうすれば、税務署が見ても問題にはならないでしょう。
出来れば、お父様の口座に100万円を入れた年に100万円を返済するのが好ましいのですが、お父様の口座が凍結されている場合には、そうはいきません。その場合は、お母さまからの債務として申告すれば問題にはならないでしょう。
ただし、お母さまの口座から引き出した時の通帳を処分したりせずに、しっかりと保管して下さい。

ありがとうございました!ご丁寧にご回答いただけて大変有り難いです。