相続した同族企業株式(非上場株式)を他の相続人に売却する際の価格と税金について

売価の目安は単純に資本金の額を株数で割れば良いのでしょうか？

⇒資本金だけではなく純資産価額を株数で除した価額によるのが適当と考えます。

またその利益は私が行なっている株式投資の損失と損益通算できますか？

⇒株式投資が上場株式等に関するものである場合には、その譲渡損失と非上場株式（同族株式）の譲渡利益との通算はできません。上場株式等間又は一般株式（非上場株式等）間であれば、それぞれの間では通算可能とされています。

回答ありがとうございます。
純資産価額の算出は個人でできるものでしょうか？
それとも税理士・会計士に依頼するものでしょうか？

　それなりの知識が必要かと思います。
　税理士に依頼されることをお勧めします。