年度末の計上仕訳について

年度末に組合人に配当金を現金で支払っています。

月末に払っているなら、未払金に計上することはないのでは？

未払金は、総会等で支払うことが決まったが、まだ支払っていないときに計上します。
例えば、７年３月末が決算日で、総会が６月15日、この日が配当金の決議の日なら、６月１５日に未払金に計上し、支払ったときに未払金が消えます。３月末は配当金を支払うことが決まっていませんので、決算で計上することはありません。

大体の法人は、決議日の翌日に配当金を支払うケースが多いと思います。この場合６月１５日に未払金を立て、６月１６日に未払金を払う処理をしますが、６月１６日に未払金を通さず配当金を払う処理をしても問題はないと思います。
ただ、住所等が不明な組合員がいると、未払金の計上が必要でしょう。