貸借対照表の事業主貸について

「事業主貸」という勘定科目は、事業用資金から生活費などの経費にならない支出をした場合に使います。
この科目が正常かどうかは内訳を見ないと判断できません。
ご自分でｆｒｅｅｅを立ち上げて「レポート」⇒「総勘定元帳」⇒「事業主貸」をクリックして、変なものが含まれていないか確認してみてください。
変な内容が含まれて

事業主貸には、生活費やクレジットカードの引き落とし時に使用しています。何故か売上高も含まれているのですが、これは合っているのでしょうか。

事業主貸○○○円/売上○○○円という仕訳は、売上金をそのままプライベート資金に使ったことになります。

その事実があれば間違いではないと思います。

売上が振り込まれる決済サービスをプライベートに使用する事が多い為、同期させずにそのサービスをプライベート資金扱いで帳簿付けしています。売上金のほとんどはゆうちょ銀行へ移動させるので、プライベート資金に使ったという表現に該当するのかどうかが不明です。移動時には事業主借で、借方ゆうちょ/貸方事業主借で別に登録しています。

どの会計ソフトやシステムでも同じだと思いますが、同期や連携にかかわらずクレジットカードや決済サービスはプライベートには使わず事業用とした方が分かりやすいですよ。

普通預金○○○円/事業主借○○○円
という仕訳は、プライベート資金を事業用口座に入金した場合です。

仰ってることが次に仕訳を省略したものなら間違いではないと思いますが、
普通預金○○○円/売上○○○円
事業主貸○○○円/普通預金○○○円

この税務相談では難しいので、申告までに現物で確認してもらった方が良さそうですね。