補助金　圧縮記帳

法人税法42条で、「その固定資産につき、その取得又は改良に充てた国庫補助金等の額に相当する金額（圧縮限度額）の範囲内でその帳簿価額を損金経理により減額し（後略）」とありますので、可能だと思います。

ただ、補助金は通常全額が益金となりますので、ご質問のようにすると補助金を受けた事業年度の課税所得は500万円増加してしまいますから、余りされることはないと思います。尤も、その500万円は減価償却費でその後の事業年度で徐々に損金となりますが。