税理士さんと依頼者の責任はどちらが重くなりますか？

税理士の指示に、不正行為がある、というのは、具体的に、どういうことなのか、全く想像できませんが、依頼者と税理士との責任関係は、ケースバイケースだと思います。

税理士が不正な指導や、不正行為を促すようなことがあれば、それ自体、論外ですが、万が一、そのようなことがあったとして、それらが、不正等に該当することが、依頼人においても、明らかにわかるような場合には、お互い様の部分もあると思うので、責任負担は、話し合いか、裁判による決着になるのかと思います。

一方、不正というよりは、誤った指導によって、依頼人が被った損失について、その指導が、依頼人からすると、合法、妥当なものだろう等と思わせるような内容であった場合には、税理士の責任が重くなるかと思いますが、その場合でも、依頼人が、税理士に対して与えた情報の内容や正確性、適切性等によっても、その責任関係は、変動すると思います。