年末調整の際の各控除について教えてください

まず、年収が260万円の場合、給与所得控除が96万円あります。
そして、ご主人の所得控除として考えられるものとしては社会保険料控除・医療費控除・配偶者（特別）控除・基礎控除があります。
住宅ローン控除はローンの年末残高の1％相当額になりますので、年々、控除額は減少します。
以上を前提に、ご主人がサラリーマンである場合の税金は次のように計算されます。
（給与所得の金額‐所得控除の金額）×税率‐ローン控除

ローン控除は先にも書きましたが、「年末残高の１％」ですので、毎年返済をしてローン残高が減少している以上は控除額も年々減少していきますのでご留意ください。
ご相談の文面からは決して無駄なことをされていることはないと思われます。

建物は、ご夫婦の共有名義ですか。
住宅ローンの支払いがご主人のみの場合、持分により、住宅ローン控除が少なくなっているかもしれません。