非居住者でも日本で納税したい

日本で源泉してもらえば、源泉税（所得税）を収めることはできると思うのですが。

日本非居住者で、ドイツの自宅からリモートワークをしているので、ドイツで納税の義務があると言われました。たとえ日本で源泉徴収を受けていても「ドイツで働いている」という枠組みになるので、ドイツに納税する必要があるようです。

ですがなんとか日本で納税し、ドイツでの納税義務を避けられる方法がないかお伺いしました。

ドイツに課税権があり、日本で納税すればドイツの課税権がなくなるという規定はありません。
外国税額控除の規定はあると思います。