事業所得から雑所得への変更

修正申告をする必要がそもそもあるかどうかですが、誤っていたのであれば、修正申告することに問題は無いと思われます。

修正申告をした場合、過去に提出した収支内訳はどのような扱いになるのでしょうか。
売上が1000万未満のため、修正申告の際は不要かと思いますが、今回修正申告したものと過去の収支内訳が税務署に残される形でしょうか。

私は税務署OBではないので、税務署内の取り扱いの詳細は存じ上げませんが、当初申告、修正申告のデータはすべて残すのが通常のはずです。当初申告を破棄するという運用は聞いたことがないので。