株の損益通算

一般口座のプラスと特定口座のマイナスは損益通算可能でしょうか

　⇒　一般口座の譲渡株式が上場株式ならば可能です。

同じ特定口座の中にプラスの銘柄とマイナスの銘柄が混在してますが、マイナスの銘柄のみ抽出して確定申告することはできますか？

　⇒　できません。

それとも申請は口座単位（一般と特定は別）になりますか？
　⇒　口座単位になります。

ありがとうございます。
もう一点教えて頂きたいのですが、
・特定口座と一般口座がある場合、一般口座のみ確定申告の対象とすることは可能ですか？
※特定は精算有なので対象とはせず
※一般は相続財産で取得したため、取得費加算の特例も使いながら確定申告が必要だと思うので

特定口座が源泉徴収有であれば、そもそも申告不要です。申告するメリットは一般口座と損益通算したり、繰越損失の控除を受けたりすることです。そういったことがなければ、申告不要のままでよいでしょう。

　ご相談に端的に答えると可能です。