母に住宅ローンの残金を支払って貰うには？

１）相続時精算課税制度で贈与
この特例を使って贈与した場合には2500万円の特別控除がありますので、1100万円を贈与して頂いても贈与税は発生しません。
ただし、この方法を選択しますと、お母様に将来ご相続が発生した場合には、お母様の相続財産に相続時精算課税制度で贈与した財産の価額を加算して、相続税を計算することが必要になります。つまり、今回は贈与税がかかりませんが、将来の相続税で精算するというものになります。そして、贈与税が発生しなくても、贈与税の確定申告を行う必要があります。
また、今後のお母様からの贈与はすべて相続時精算課税制度の対象となりますので、この点も注意する必要があります。

２）マンションの一部をお母様に買取って頂く
現在お持ちのマンションのうちの1100万円相当（持分）をお母様に買取って頂く場合には、受け取る金額（1100万円）はマンションの売却代金になりますので、贈与税の対象にはならず、所得税住民税の対象となります。仮に購入時よりも値下がりして、譲渡益がでない場合には所得税住民税もかからないことが考えられます。
例えば、現在のマンションの時価が3000万円の場合には「30分の11」の持分を、時価が2500万円の場合には「25分の11」の持分を売買することになります。
この方法の注意点は、①売買するにあたって適正な時価を算定すること、②売買することにより名義変更を行いますので登記費用や不動産取得税がかかること、③売買によって譲渡益が生じる場合は所得税住民税がかかること、があります。
なお、具体的な税金計算はご相談の文面からでは困難ですのでご容赦ください。

ご参考になれば幸いです。