親からの預かり金、申告して贈与税を払うべき？返金できる？子供の教育費に充てられる？

ひとまず、預かっているということにしておきましょう。
贈与はあげる側ともらう側で「あげます」「もらいます」の双方の合意があって成立します。
預かっているだけのものに贈与税は課税されません。
教育資金として贈与をうけるのであれば、それはまた別途、教育費の贈与と分かるような形を作っていただく方が良いです。
なお、教育資金一括贈与の特例を使うには信託銀行で契約する必要があります。
教育資金一括贈与の特例を適用しなくとも、必要な都度される教育費や養育費の贈与は非課税で、申告も不要です。

迅速にご回答くださり、本当にありがとうございます。
母に早速伝えましたところ、「迷惑かけたので110万はもらって」と言われました。
もし、差し引いた290万を返金すると問題ありますか？

重ねての質問で恐縮ですがよろしくお願い致します。

それでは、記録として明瞭になるように、400万円を一旦全額返金していただいて、その後に改めて110万円の贈与を受けることをお勧め致します。

早速のご回答、心より感謝いたします。
おっしゃる通りに致します。
税の仕組みに納得、スッキリしました！
今後の金銭の取り扱いは慎重に進めます。
本当にありがとうございました。