年末調整でマイナスがついている意味は？

控除欄でマイナスの表示であれば、年末調整還付金と思われます。
一年間天引きされていた所得税が結果的に多かった差額分が還付金として表示されているかと思います。
一度確認ください。

私にとってプラスなのに、マイナスという表記に違和感があります。
ということは、引かれる社会保険料が減ったのではなく、還付金と相殺されたのですね？
年間の社会保険料の合計額を出したいのですが、ほぼ今まで通りの金額の社会保険料は支払っているという意味でいいのですよね？

追加ですが。
還付金は1月給与かと思ってました。
12月が普通ですか？

会社によりますので、12月のところも多いです。