前期で計上した仕入を、当期の仕入に修正したい

5月に仕入計上(100万円)しなければいけないものを、決算期末の3月に計上したのであれば、修正申告をする必要があると思います。そして、前期の帳簿を修正する必要があります。

正しい仕訳としては下記になりますが、
3/31　仕掛品1,000,000 / 買掛金1,000,000
5/31　材料仕入1,000,000 / 仕掛品1,000,000


普通、仕掛品（＝未成工事支出金）は、決算で使う科目です。
上記の仕訳が間違っているように思います。

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この仕訳は、正しい仕訳に思います。

前期に誤った仕訳は下記になります。
3/31　材料仕入1,000,000 / 買掛金1,000,000


なお、この仕入れた材料が施工中の工事に使われ、未完成で、決算は工事完成基準を適用しているならば、仕掛品として繰り越します。
仕掛品（未成工事支出金）//期末未成工事支出金　1,000,000


3/31に材料を仕入れていないのならば、
「 3/31　仕掛品1,000,000 / 買掛金1,000,000」もあり得ない仕訳です。仕掛品を期中に使うのもおかしいです。

補足

3/31　仕掛品1,000,000 / 買掛金1,000,000


この仕訳は、借方資産科目、貸方負債科目であり、損益とは無関係です。前期損益は間違っていないと思います。

材料仕入を5/31に計上したいのですが、
前期損益修正益を使うのでしょうか？


修正仕訳としましては、
借方：買掛金1,000,000　貸方：前期損益修正益1,000,000
となります。

その後（5/31)に正しい仕訳
借方：材料仕入1,000,000貸方：買掛金1,000,000
を入れて下さい。

よろしくお願いいたします。