個人が会社にパソコンを売却した場合、どんな書類を準備する必要がありますか？

会社とは、同族関係にある会社と思われますがいかがですか。
この場合、正当な価額の設定でなければならないことは勿論ですが、取引対価や金銭授受事実を示す請求書、領収証は最低限必要になります。
消費税の仕入税額控除を受けるうえでは不可欠なのです。
さらにこういった取引事実を証明するものが存在しない場合、何に基づいて記帳しているのか記帳全体の信憑性を問われますね。まして、同族関係においては、他社にもまして原則を貫いた方が賢明と思われます。