土地、家屋の高額譲渡について

高額譲渡は、譲渡価額が適正な時価よりも高い場合をいいます。
固定資産評価額の1.5倍くらいの価格というのも、不動産鑑定評価を取得して、当該金額の1.5倍なら高額譲渡と言えるかと思います。
（固定資産評価額も何を示されているかによるかと思います。例えば、固定資産税評価額はそのまま時価とは言い難いかと）

売主の個人は時価と譲渡価格の差も譲渡所得ですが、買主側の法人は寄附金扱いになりますが、寄附金は損金算入限度額の範囲で損金算入できます。

ありがとうございます。法人と言っても1人オーナー企業で小さい会社です。寄付金の損金算入限度額は低いのではないでしょうか？

寄附金は損金算入限度額は法定の計算式での算定結果次第ですが、あまり大きくはないことが多いかと思います。

二重課税のように見える（税額が売り手からも買い手からも発生）というのも、税法のルールとして存在しているため、やむを得ないものです。割り切っていただくしかないです。
このケース以外でも法令が歪んで見えてしまうものはありますので。