インボイス制度消費税の支払い対象期間

２年前が基準というのは、２年前に1000万超えていたかどうかを確認するだけですか？

→2年前を基準期間といい、その年に消費税の申告納税義務があるかどうかを判断するだけなので、その通りです。

実際の支払い対象の期間は、2023年の10月～12月の売上分の二割(二割特例使用)で大丈夫ですか？

→令和5年10月からインボイス発行事業者になったのでしょうか？そうであれば2年前の課税売上高は1,000万円以下でしょうから、インボイス発行事業者になっていなければ令和5年は免税事業者なので、令和5年10月1日～12月31日の課税売上に係る消費税額×20％（2割特例）の納税を選択できます。

２年前が基準と言われると、２年前の売上分の消費税を支払うのかと迷ってしまって…。

→消費税に限らず税金は過去の売上等で計算しません。

2023年から弥生のオンライン青色申告で帳簿付けや確定申告書を作っています。そこで消費税の申告書も自動で計算されていたので、やはりそのまま計算された消費税の支払いで大丈夫でしょうか？

→弥生の青色申告オンラインを使っている税理士はいないと思います。私も使用していませんので、大丈夫かどうかは判断できません。
弥生にお問い合わせください。

２年前の売上分の消費税を支払うんだと言う人がいたので不安になりました。

→2つ上の回答の通りです。

丁寧な回答ありがとうございました。とても理解しやすかったです。
初めての消費税の申告ですがなんとかなりそうです。